SMP NU Pakis memiliki fasilitas unggulan berupa aula terbesar di tingkat kecamatan yang representatif, nyaman, dan multifungsi. Aula ini digunakan untuk berbagai kegiatan sekolah, seperti seminar, pelatihan, perlombaan, pentas seni, kegiatan keagamaan, pertemuan wali murid, hingga acara wisuda. Dengan kapasitas yang luas serta didukung sarana pendukung yang memadai, aula mampu menampung peserta dalam jumlah besar sehingga berbagai kegiatan dapat berlangsung dengan tertib, aman, dan nyaman.